При всем уважении, давайтк придержим коней. Никаких фторопластов. Если конечно у вас нет другого материала.
Во первых, он не клеится, совсем.
Во вторых он хладотекуч, что модет привести к тому, что изоляция ваша продавится насквозь, проводом, обмоточным. На толстом не наблюдал, на пленке наблюдал.
В третьих цифры, вами приведенные есть пробивное напряжение в киловольтах, на 1 мм толщины.
Еще раз взвесьте, надо ли вам работать с напряжением, да еще и с высоким.
В последних какой трансформатор вы делаете? Сопротивление, топология, мощность наконец?